Вавиловский журнал генетики и селекции включен ВАК Минобрнауки России в Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук, Российский индекс научного цитирования, ВИНИТИ, базы данных Scopus, Ebsco, DOAJ, Urlich’s Periodicals Directory, Google Scholar, Russian Science Citation Index на платформе Web of Science.