Программа для оценки длины теломерных районов хромосом (MeTeLen)

MeTeLen


Программа “MeTeLen” (Measurement of Telomer Length of chromosomes) была разработана для оценки длины теломер индивидуальных хромосом человека методом Q-FISH

Программа написана на языке C# (.NET platform).

Требования к системе для запуска программы:

  1. Процессор 1 GHz
  2. ОЗУ 512 MB
  3. Операционная система Windows
  4. Требуется установка .NET framework для версий операционной системы ниже XP
  5. Программа “MeTeLen” работает с двумя типами изображений: бус, обладающих стандартной флуоресценцией и метафазных хромосом (24 bits RGB images). Изображения бус используются для нормировки данных о длине теломер, полученных в разных экспериментах, а также с целью коррекции неравномерного освещения анализируемых изображений. Для анализа каждой метафазной пластинки используется набор из двух монохромных изображений, выполненных в разных каналах. Синий канал представляет собой окрашенные DAPI метафазные хромосомы и служит для идентификации хромосом и их регионов. Красный канал содержит результаты FISH с флуоресцентно меченной PNA (protein nucleic acid) теломерной пробой и необходим для вычисления интенсивности сигналов флуоресценции теломерных последовательностей отдельных хромосом.

    В директории выложен исполняемый файл программы .

    Ошибки, замечания и вопросы по программе можно высылать на адрес mantis_anton@bionet.nsc.ru



    Example of Q-FISH image and masks(.zip)

    Bead imgs(.zip)

    Certificate (.pdf)