База данных «Пространственные структуры функцилнальных сайтов белков (PDBSite)»

АВТОР

К.б.н. Иванисенко В.А.

ХАРАКТЕРИСТИКА

База данных предназначена для функциональной аннотации белковых молекул, реконст-рукции сетей белок-белковых и белок-лиганд взаимодействий. База данных содержит информа-цию о пространственной структуре функциональных сайтов белков, включая: сайты каталитиче-ских центров ферментов, сайты пострансляционных модификаций белков, сайты связывания ио-нов металлов, сайты связывания органических и неорганических лигандов, сайты связывания бел-ков, ДНК и РНК. 

Рис. 2 Молекулярный комплекс белков NS5B вируса гепатита С и NTF2 человека.

ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА

База данных обеспечивает пользователя информацией о функционально важных свойств структуры белков, необходимых для решения задач идентификации функции белков, поиска ми-шеней для лекарственных препаратов и целенаправленного конструирования белков с улучшен-ными медико-биологическими свойствами, а также о пространственных структурах комплексов лиганд-активный сайт.

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ

База данных может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и био-технологии, а также других областях, связанных с изучением функционального строения белков и молекулярно-генетических систем.

УРОВЕНЬ ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ

База данных использовалась для решения задачи поиска перспективных мишеней действия лекарственных препаратов, направленных против вируса гепатита С.

ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА

Разработанная база данных прошла официальную регистрацию № 2005620266.

КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лицензионное соглашение.

ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ

Не рассчитывалась.

КОНТАКТНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Колчанов Николай Александрович
Зам.директора Института, член-корр.РАН
Институт цитологии и генетики СО РАН,
Просп.академика Лаврентьева,10, г.Новосибирск 630090
Email: kol@bionet.nsc.ru
WWW: http://www.bionet.nsc.ru