База данных «Генные сети Арабидопсиса (ГСА)/Arabidopsis GeneNet Supplementary (AGNS)»

АВТОРЫ

Омельянчук Н.А., Поплавский А.С., Миронова В.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А

ХАРАКТЕРИСТИКА

Разработанная база данных "Генные сети Арабидопсиса (ГСА)/Arabidopsis GeneNet Supplementary (AGNS)", содержит информацию о генах, регулирующих морфогенез, их экспрес-сии, влиянии мутаций на молекулярный и морфологический фенотип растений 

ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА

БД "AGNS" обеспечивает представление данных по морфогенезу растений в формате, де-тально описывающем морфогенез от нуклеотидной последовательности до фенотипа, и, в тоже время, позволяет производить компьютерный логический анализ этих данных. В мире не сущест-вует аналогов такой базы данных. База содержит информацию о экспрессии генов, полученных в различных экспериментах (RT-PCR, blot, in situ, GUS, GFP и другие), а также данные о фенотипи-ческих аномалиях в мутантах и трансгенных линиях. БД "AGNS" позволяет накапливать и анали-зировать эту информацию в удобном формате для дальнейшего ее использования (планирование экспериментов, моделирование, построение генных сетей).

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ

БД "AGNS" может быть использована для построения математических моделей, генных сетей, а также для построения опытов по трансгенезу растений. Система ввода и контрольные сло-вари базы могут использоваться отдельно, в качестве лабораторного журнала для исследователей, ведущих разработки на Арабидопсисе, а также в качестве учебного пособия для лабораторных практикумов по генетике растений.

УРОВЕНЬ ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ

Реализован веб - доступный пользовательский интерфейс, в который входит: система за-просов, система ввода, система навигации, перекрестные ссылки, линки в базы данных TAIR и PubMed. База данных успешно используется для построения генных сетей и моделирования развития

ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА

Получено свидетельство об официальной регистрации № 2006620170.

КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лицензионное соглашение.

ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ

Не рассчитывалась.

КОНТАКТНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Колчанов Николай Александрович
Зам.директора Института, член-корр.РАН
Институт цитологии и генетики СО РАН,
Просп.академика Лаврентьева,10, г.Новосибирск 630090
Email: kol@bionet.nsc.ru
WWW: http://www.bionet.nsc.ru