База данных «База математических моделей молекулярно-генетических процессов (Модельер)/Database of mathematical models of molecu-lar genetic processes (ModelER)»

АВТОРЫ

Ратушный А.В., Недосекина Е.А., Лашин С.А., Турнаев И.И., Владимиров Н.В., Лихошвай В.А.

ХАРАКТЕРИСТИКА

База данных "ModelER" предназначена для накопления математических моделей, описывающих регуляцию ферментативных реакций, эффективность экспрессии генов, формирование белковых комплексов, трансдукцию сигналов и др. В базу могут вноситься математические моде-ли как с верифицированными, так и с оцененными структурой и параметрами. Верификация моделей производится с использованием количественных и качественных опубликованных экспериментальных данных. Единицей входа в базу является математическая модель определенного молекулярно-генетического процесса. 

ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА

База данных содержит оригинальные и опубликованные математические модели кинетики более 300 ферментативных реакций Escherichia coli. По количеству кинетических моделей фер-ментативных реакций для определенного организма база данных не имеет аналогов в Российской Федерации и за рубежом

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ

База данных "ModelER" может быть использована при построении математических моде-лей различных совокупностей внутриклеточных процессов (например, ферментативных реакций определенного метаболического пути), для исследования кинетики участвующих в исследуемой совокупности процессов молекулярных компонентов (в частности, для решения биотехнологиче-ски значимых задач).

УРОВЕНЬ ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ

База данных реализована в виде флэт-файла. Планируется провести пополнение базы дан-ных математическими моделями регуляции экспрессии генов, кодирующих белки ферментатив-ных комплексов Escherichia coli. Также планируется реализация интернет-доступной версии базы данных.

ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА

Получено свидетельство об официальной регистрации № 2006620196.

КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лицензионное соглашение.

ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ

Не рассчитывалась.

КОНТАКТНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Колчанов Николай Александрович
Зам.директора Института, член-корр.РАН
Институт цитологии и генетики СО РАН,
Просп.академика Лаврентьева,10, г.Новосибирск 630090
Email: kol@bionet.nsc.ru
WWW: http://www.bionet.nsc.ru