База данных «Гены-сенсоры (ГенСенсор)/Genes-sensor (GenSensor)»

База данных «Гены-сенсоры (ГенСенсор)/Genes-sensor (GenSensor)»

АВТОРЫ

Хлебодарова Т.М., Степаненко И.Л., Подколодный Н.Л.

ХАРАКТЕРИСТИКА

База данных "GenSensor" предназначена для накопления информации, необходимой для создания геносенсорных конструкций на основе бактериальных генов и содержит данные о струк-туре бактериальных промоторов, экспрессия которых активируется в ответ на определенное внешнее воздействие, механизмах индукции, чувствительности к воздействию, а также условий, при которых наблюдается максимальный ответ на данный тип воздействия. 

ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА

Несмотря на существование целого ряда баз данных, содержащих информацию о структуре бактериальных промоторов (EcoCyc, Regulon, Prodoric и др.), база "GenSensor" является уникаль-ной в той ее части, которая описывает чувствительность промоторов генов к индукторам, уровни и механизмы индукции. Это делает ее пригодной для практического использования с целью созда-ния геносенсорных конструкций самого разного назначения, в том числе, для оценки чистоты ок-ружающей среды и скрининга продуктов, лекарственных препаратов, предметов постоянного пользования и др., на токсичность и/или мутагенность

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ

База может быть использована для поиска генов, тонко чувствующих присутствие в среде различных токсических для клетки веществ, и представляет интерес для исследователей, зани-мающихся разработкой и созданием новых, высокоэффективных и чувствительных методов, кото-рые бы в отсутствие знаний о природе токсического для клетки вещества, выявляли его присутст-вие в биологических средах

УРОВЕНЬ ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ

База данных реализована в среде SRS (Sequence Retrieval System), имеет стандартный web-интерфейс, который позволяет производить поиск с использованием комбинаций условий на зна-чения полей в различных таблицах базы данных. В настоящий момент база содержит информа-цию о более чем 100 промоторах, реагирующих на различные стрессорные воздействия, в том числе, на присутствие в среде токсических веществ и мутагенов. Развитие базы создает основу для разработки и создания геносенсоров различного назначения.

ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА

Получено свидетельство об официальной регистрации № 2006620197.

КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лицензионное соглашение.

ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ

Не рассчитывалась.

КОНТАКТНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Колчанов Николай Александрович
Зам.директора Института, член-корр.РАН
Институт цитологии и генетики СО РАН,
Просп.академика Лаврентьева,10, г.Новосибирск 630090
Email: kol@bionet.nsc.ru
WWW: http://www.bionet.nsc.ru