Ромащенко Аида Герасимовна

Ромащенко Аида Герасимовна

Известный специалист в области молекулярной генетики и биохимии.

Ромащенко А.Г.  родилась 27 сентября 1941 года в г. Кутаиси. После окончания средней школы работала на заводе. В 1960 году поступила в Новосибирский госуниверситет на факультет естественных наук, и в 1966 году после окончания университета была зачислена в Институт цитологии и генетики СО АН СССР старшим лаборантом в лабораторию нуклеиновых кислот и прошла весь путь от лаборанта до зав. лабораторией.

Еще будучи студенткой А.Г. Ромащенко начала разработку метода выделения дезоксинуклеозид-5-трифосфатов путем ферментативного гидролиза ДНК и хроматографического разделения смеси нуклеотидов на ионообменных смолах. Разработанный Ромащенко А.Г. способ получения дезоксимононуклеотидов лежит в основе современного производства этих соединений в стране.  В эти же годы были разработаны методы получения  дезоксинуклеозидтрифосфатов, а также матриц и затравок, в том числе и регулярных полидезоксинуклеотидов, без которых немыслима организация исследований по матричному синтезу ДНК. Существенный вклад внесён ею в создание ферментативных методов синтеза меченных тритием, углеродом и фосфором дезоксинуклеозидтрифосфатов и их предшественников.

С 1970 по 1978 гг. Ромащенко А.Г., будучи на общественных началах руководителем Отделения №1 НИКТИ БАВ, участвовала в разработке методов выделения высокоочищенных препаратов ферментов биосинтеза ДНК. За это время разработаны методы выделения транс-N-дезоксирибозилаз, неспецифической фосфотрансферазы из моркови, эндонуклеазы I и экзонуклеазы III из E.coli, а также ДНК- полимеразы I, а в дальнейшем фрагмента Клёнова. По разработанным технологическим регламентам НИКТИ БАВ и НИС НГУ в течение продолжительного времени выпускало соответствующую продукцию.

Ромащенко А.Г.  разработан оригинальный метод получения высокоочищенных препаратов панкреатической ДНК-азы. свободной от примесей РНК-азы и др. сопутствующих белков.  В это время с участием Ромащенко А.Г. были открыты, описаны и выделены новые ферменты -бактериальная обратная транскриптаза и фермент, катализирующий безматричную полимеризацию дезоксинуклеозиддифосфатов. Под её руководством разработан метод получения высокоочищенных препаратов обратной транскриптазы E.coli и доказано, что фермент может служить полноценным заменителем вирусной ревертазы в экспериментах in vitro.

При её участии были разработаны уникальные методы, позволившие впервые в мире продемонстрировать обратную транскрипцию в бактериальной клетке. Впервые  совместно с лабораторией Кумарева В.П. была исследована  репликация серных аналогов,  синтезированы в препаративных масштабах трифосфатные аналоги моно- и трифосфатов дкзоксинуклеозидов.

Было выдано 6 авторских свидетельств на эти работы.

 В 1984г. ей была присуждена ученая степень кандидата биологических наук сразу по двум специальностям: «генетика» и «биохимия». Тема диссертации: «РНК-зависимая ДНК-полимераза Escherichia coli: выделение и свойства».

С 1980 по 1987 г. Ромащенко А Г. – руководитель группы молекулярной цитогенетики, а с 1987г.– зав. лабораторией молекулярных основ генетики животных.  В лаборатории были разработаны методы, позволившие исследовать тонкую структуру генома эукариот. Было обнаружено и изучено новое семейство тандемно организованных повторяющихся последовательностей ДНК, специфичных только для таксона Собачьих. Структурно-функциональная диагностика генетических текстов повторов показала, что эти некодирующие последовательности ДНК потенциально способны выполнять регуляторные функции. Установлено, что этот тип повторов имеет иерархическую структуру, что свидетельствует о поэтапном (стадийном) характере их эволюции. Доказано, что в ходе эволюции в геномах разных видов семейства Canidae было фиксировано лишь ограниченное число структурных вариантов повторов. Таким образом, на экспериментальной модели было доказано существование селектирующих факторов в геномах эукариот, помимо положительного отбора, определяющих эволюцию и фиксацию новых последовательностей ДНК. Было установлено, что решающее значение для фиксации определенных структурных вариантов повторов имели эволюционные события, типа репликаций и рекомбинаций. Была разработана методология, позволяющая датировать эволюционные события на временном промежутке в 50 млн. лет. В результате было установлено, что основные события в эволюции повторов коррелирует с формообразовательными процессами внутри семейства Canidae. Дальнейшие работы Ромащено А.Г. сосредоточены на выяснении потенциальных функциональных возможностей Bsp - повторов в регуляции генетического материала в геномах видов семейства Собачьих и идентификация генов, наиболее восприимчивых к действию факторов внешней среды.

В 2012г. Ромащенко А.Г. возглавила созданный межинститутский сектор молекулярной палеогенетики.  С 2015 г. она ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики человека.

Ромащенко А.Г. в течение многих лет вела интенсивную деятельность по подготовке специалистов в области молекулярной биологии и биохимии. Под её руководством выполнено более 60 дипломных работ выпускников НГУ и других вузов, она была руководителем двух  и соруководителем трех  кандидатских диссертаций.

Ромащенко А.Г.   награждена правительственным орденом «Знак почета». Она автор и соавтор более 200 научных работ,  6 авторских свидетельств на изобретения и 5 патентов.

Основные публикации:

Ромащенко А.Г. Исследование связи между противовирусной и ферментативной активностью дезоксирибонуклеазы // Вопросы вирусологии. 1969, №5, с. 532-537.

Салганик Р.И., Трухачев А.А., Баталина Т.А., Панкова Т.А., Томсонс В.П., Ромащенко А.Г., Горель Ф.Л. Противовирусное действие дезоксирибонуклеазы и рибонуклеазы //В кн.: Проблемы теоретической и прикладной генетики. Новосибирск. 1973, с. 118-119.

Юшкова Л.Ф., Неханевич Н.Ф., Потапов В.А., Ромащенко А.Г. Модификация метода выделения ДНК-полимеразы из E.сoli //Биохимия. 1976, т.41, вып.3, с. 420-425.

Назаренко И.А., Беляева Т.А., Воробьева Н.В., ..Ромащенко А.Г. и др. Выделение фермента, катализирующего полимеризацию дезоксинуклеозиддифосфатов из препаратов ДНК-полимеразы I E.coli. //Молекулярная биология.1976, т.10, вып.6, с.1231-1237.

Ромащенко А.Г., Воробьева Н.В., Кожемякина Н.Н.  и др. Отделение от препаратов ДНК-полимеразы I РНК-зависимой ДНК-полимеразы; очистка и свойства фермента //Доклады академии наук СССР. 1977, т. 233, с.734-737.

Назаренко И.А., Потапов В.А., Ромащенко А.Г., Салганик Р.И. Separation of the enzyme catalyzing polymerization of deoxyribonucleoside diphosphate from the preparation DNA -polymerase I of E.coli //FEBS Letters 1978, v.86, p.201-204.

Лушникова Т.П., Подгорный В.Ф. Ромащенко А.Г., и др. Избирательное связывание тРНК-зависимой ДНК-полимеразой E.coli //Молекулярная биология. 1978, №12, С. 1163-1171.

Назаренко И.А., Бобко Л.Е., Ромащенко А.Г., и др. Исследование природы безматричного синтеза [d(A-T)]-сополимера, катализируемого препаратами ДНК-полимеразы I E.coli //Мол. биология. 1979, №13, с. 216-227.

Графодатский А.С., Лушникова Т.П., Ромащенко А.Г., Раджабли С.И. Цитологическая локализация повторяющихся последовательностей ДНК у трех видов млекопитающих // Генетика. 1981, т.17, №10, с. 1983-1987.

Воробьева Н.В., Небрат Л.Т., Потапов В.А., Ромащенко А.Г.  и др. Обратная транскрипция гетерополимерной РНК с помощью РНК-зависимой ДНК-полимеразы E.coli //Мол. Биология.  1982., т.16, вып. 5, с. 977-983.

Грабкина О.А., Воробьева Н.В., Бунева В.Н., Нагибнева И.Н., Панфилова З.И., Ромащенко А.Г., Сердюкова Н.А., Локализация комплекса РНК-зависимой ДНК-полимеразы с эндогенной матрицей и дискриминация алкилирующим гамма-амидом dTTP РНК-и ДНК-зависимого синтеза ДНК в клетках Escherichia coli  //Молекулярная биология. 1983, т.17, вып. 5, с. 1019-1027.

 Ромащенко А.Г., Воробьёва Н.В., Грабкина О.А. и др. Внехромосомные элементы E.coli во фракции, содержащей нуклеопротеидные комплексы обратной транскриптазы с эндогенной матрицей //Докл. АН СССР 1984, т.277, №5, с.1264-1266.

Графодатский А.С., Лушникова Т.П., Ромащенко А.Г., Раджабли С.И. Распределение структурного гетерохроматина и повторяющихся последовательностей ДНК на хромосомах ряда видов куницеобразных //Генетика. 1985, т.XXI, №1, с.147-152.

Ромащенко А.Г., Потапов В.А., Иванов С.В. и др. Сравнительное изучение свойств высокоповторяющейся ДНК лисицы и песца //Генетика. 1987, т.23, №6, с. 1104-1112.

Ромащенко А.Г., Потапов В.А., Сосновцев С.В. и др. Структура сложных повторов прицентромерного гетерохроматина лисицы: регуляторные элементы контроля репликации, рекомбинации и генной экспрессии //ДАН СССР. 1988, т.299, №5, с. 1250-1255.

Ромащенко А.Г., Лушникова Т.П., Графодатский А.С., Раджабли С.И. Хромосомная локализация и эволюционный возраст сателлитных ДНК куницеобразных //Генетика. 1988, т.24, №12. С. 2134-2140.

Ромащенко А.Г., Потапов В.А., Соловьев В.В. Распределение, структура и функциональная значимость сложных повторяющихся последовательностей ДНК в геномах животных // Кол. Монография «Структурно-функциональная организация генома». Новосибирск, «Наука». 1989, с.80-114.

Иванов С.В., Потапов В.А., Филипенко Е.А., РомащенкоА.Г. Гетерогенность семейства Bsp-повторов Canidae, обнаружение EcoRi  -подсемейства //Генетика. 1991, т.27, №6, с. 973-983.

Беляева Т.А., Вишнивецкий П.Н,. Потапов В.А. , Железова А.и., Ромащенко А.Г. Species-and tissue-specific  transcription of complex, highly repeated satellite-like Bsp elements in the fox genome //Mamm. genome. 1992,v. 3(4), р. 233-236.

Кудряшова Н.В., Шаманина М.Ю., Годовикова Т.С., Ананько Е.А., Ахмадиева Ф.Ф., Ромащенко А.Г. Особенност взаимодействия ДНК-полимеразыI Escherichia coli и ее большого фрагмента С гамма-n-азидоанилидом dTTP //Биохимия . 1993, т.53, вып.2, с.224-233.

Сосновцев С.В., Иванов С.В., Ромащенко А.Г. Блочная эволюция Bsp-повторов: формирование субповторов и мономеров предшествовало расхождению четырех видов Canidae //Мол. биология. 1993, т.27. №5, с. 992-1013.

Кель О.В., Кель А.Е.,Wingender E. ,Ромащенко А.Г. ,Колчанов Н.А.  A compilation of composite regulatory elements affecting gene transcription in vertebrates //Nucl. Аcids Res. 1995, v.23, №20, р. 4097-4103.

Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Ромащенко А.Г., и др. Распределение транскриптов Bsp-повторов Canidae в почке песца: структурное сходство Bsp-повторов с SINEs // Докл. Академии наук. 1995, т.343, №2, с. 260-264.

Ромащенко А.Г. Молекулярная эволюция генома Canidae //В кн.: Современные концепции эволюционной генетики. Новосибирск, 1997, с.299-302.

Кель А.Е., Колчанов Н.А… Ромащенко А.Г. и др. TRRD: база данных транскрипционных регуляторных районов генов эукариот //Мол. биол. 1997, т.31, №4, с. 626-636.

Кель О.В., Кель А.Е., Ромащенко А.Г. и др. Композиционные регуляторные элементы: классификация и описание в базе данных COMPEL //Мол. Биол. 1997., т. 31, №4, с. 601-615.

Ромащенко А.Г., Воевода М.И., Кобзев В.Ф. и др. Генодиагностика на основе полимеразной цепной реакции с последующим анализом продуктов амплификации //В кн.: Научно-прикладные разработки СО РАН. Институт цитологии и генетики. Новосибирск, 1997, с. 64-65.

Ромащенко А.Г., Юдин Н.С., Потапова Т.А. и др. Наследственно обусловленная устойчивость к вирусу ВИ1: популяционные частоты делеции 32 п.н. гена хемокинового рецептора ССR5 в Северной Азии //В кн.: Медицинская генетика: проблемы диагностики, профилактики и диспансеризации больных с наследственной патологией. Томск, 1998, с.31-33.

Ромащенко А.Г., Юдин Н.С., Виноградов С.В. и др.  Distribution of CCR5 delta 32 gene deletion across the Russisn part of Eurasia //Hum. Genetics. 1998, №6, р. 695-698.

Ромащенко А.Г., Колчанов Н.А., Игнатьева Е.В. и др. Transcription regulatory regions database (TRRD): new possibilities provided by release 4.0.  //In Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of genome regulation and structure. 1998. Новосибирск-Алтай, Россия. V.1, р. 25-28.

Ромащенко А.Г., Воевода М.И., Ситникова В.В. и др. Молекулярно-генетический анализ митохондриальной ДНК представителей пазырыкской культуры Горного Алтая (IV –II вв до н.э.) //ДАН АН 1998, т.358, №4, с. 564-566.

Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Воевода М.И. и др. Палеогенетический анализ генофонда населения Сибири //В кн.: Интеграционные программы фундаментальных исследований. Новосибирск, Изд-во СО РАН, 1998, с. 306-318.

Ромащенко А.Г., Колчанов Н.А., Подколодная О.А. и др. Transcription regulatory regions database (TRRD): its status in 2000 //Nucleic Acids Res. 2000, v.28, No.1, p.298-301.

Ромащенко А.Г., Юдин Н.С. Молекулярная эволюция Bsp-повторов: структурообразование и механизмы информационного насыщения молекул ДНК //В кн.: Современные концепции эволюционной генетики, под ред. В.К. Шумного и А.Л. Маркеля, Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2000, с. 177-192.

Кель-Маргулис О.В., Ромащенко А.Г., Колчанов Н.А. и др.  COMPEL: a database on composite regulatory elements providing combinatorial transcriptional regulation //Nucleic Acids Res. 2000, v.28, p.311-315.

Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Population aspects of genome medicine. //In: Proceedings of IV ISTC Scientific Advisory committee seminar on «Basic science in ISTC activities.” Novosibirsk, 2001, р. 241-247.

Ромащенко А.Г., Кузнецова Т.Н., Рузанкина Я.С. и др. Обнаружение двух полиморфных сайтов в гене c-fms   человека: частоты аллелей и генотипов в некоторых популяциях России //Генетика. 2002, т.38, 31, с. 33-40.

Воевода М.И., Устинов С.Н., Юдин Н.С…. Ромащенко А.Г. и др. Связь полиморфизма гена хемокинового рецептора CCR2 с инфарктом миокарда //Доклады Академии наук. 2002, т. 385, №2, с. 279-282.

Никитин Ю.П., Душкин М.И., Рагино Ю.П., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Некоторые молекулярно-биологические механизмы атеросклероза и его осложнений //Бюллетень СО РАМН, 2002, №2, с. 14-19.

Найкова Т.М., Кондрахин Ю.В., Рогозин И.Б., Воевода В.И., Юдин Н.С., Ромащенко А.Г., Concerted changes in the nucleotide sequences of the intragenic promoter regions of eukaryotic genes for tRNAs of all specificities // J. Molecular evolution. 2003, v.57,no.5, p.520-532.

Михайлова С.В., Кобзев В.Ф., Куликов И.В., Ромащенко А.Г. и др. Полиморфизм гена HFE, ассоциированного с наследственным гетерохроматозом, в популяциях России //Генетика. 2003, т.39, №7, с. 988-995.

Дамба Л.Д., Губина М.А., Гыргокау Л.А., Ромащенко А.Г. Особенности полиморфизма митохондриальной ДНК в некоторых популяциях коренных жителей Дальнего Востока //В кн.: Генофонд населения Сибири. Сборник научных статей. Отв. редакторы В.И. Коненков. В.П. Пузырев, М.И. Воевода. Н-ск, изд-во Института археологии и этнографии СО РАН. 2003, с. 14-18.

Кузнецова Т.Н., Воевода М.И., Подколодная О.А., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Устинов С.Н., Малютина С.К., Логвиненко Н.И., Журавская Э.Я, Чердынцева Н.В., Туманов Ю.В., Морозова О.А., Баум В.А., ромащенко А.Г. Делеционный полиморфизм 11-ого интрона гена c-fms человека: частоты аллелей в некоторых популяциях России и возможная функциональная значимость //Генетика. 2004, т.40(1), с. 102-112.

Максимов В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. и др. Полиморфизм генов-кандидатов и врожденные пороки сердца //Медицинская генетика. 2005, №6, часть II, с. 222-223. (Материалы V съезда Российского общества генетиков).

Михайлова С.В., Онопченко О.В., Суханов А.В., Максимов В.Н., Гаскина Т.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Гаплотипический анализ гена HFE в популяции русских и среди пациентов с мультифакторными заболеваниями //Вавиловский журнал генетики и селекции. 2006, т.10, №3, с. 504-513.

Воевода М.И., Куликов И.В., Шахтшнейдер Е.В., Максимов В.Н., Пилипенко И.В., Терещенко И.П., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Никитин Ю.П. Популяционное исследование спектра мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в российской популяции //Генетика. 2008, т.44, №10, с. 1374-1378.

Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И. Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии //Молекулярная биология. 2010. Т.44, №6, с. 983-994.

Михайлова С.В., Бабенко  В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. The ethnospecific distribution of the HFE haplotypes for IVS2(+4)t/c, IVS4(-44)t/c, and IVS5(-47)g/a in populations of Russia and possible effects of these single-nucleotide polymorphisms in splicing //Genetic testing and molecular biomarkers. 2010,v.14,no.4, p.461-469.

 

 

Пилипенко А.С., Молодин В.И., Ромащенко А.Г. Митохондриальная ДНК женщины из пещеры Каминная (Горный Алтай) эпохи позднего неолита //Вавиловский журнал генетики и селекции. 2011, т.15, №4, с. 633-643.

Barkhash A.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romaschenko A.G. Association of IL28B and IL10 gene polymorphism with predispositionto tick-borne encephalitis in a Russian population // Ticks Tick Borne Diseases. 2016. V. 7. Issue: 5. P. 808-812. 

Губина М.А., Куликов И.В., Бабенко В.Н., Чикишева Т.А., Ромащенко А.Г., Воевода М.И., Молодин В.И. Динамика состава гаплотипов мт ДНК древнего населения горного Алтая от эпохи ранней бронзы (iii тыс. до н. э.) до железного века (ii–i вв. до н. э.) // Генетика. 2016. Т. 52. № 1. С. 106-119.

Бархаш А. В., Бабенко В. Н., Воевода М. И., Ромащенко А. Г.  Полиморфизм генов CD209 и TLR3 в популяциях Северной Евразии // Генетика. 2016. Т. 52. № 6. С. 697–704.