Графодатский Александр Сергеевич

Графодатский Александр Сергеевич

доктор биологических наук, профессор

 

А.С. Графодатский- известный специалист в области цитогенетики человека и животных, эволюции млекопитающих.

Большинство его публикаций посвящено проблеме организации и эволюции хромосомных наборов геномов человека и животных, прежде всего млекопитающих. При его участии выполнены первые отечественные работы с использованием методов дифференциальной окраски хромосом.Проведено детальное описание дифференциально окрашенных хромосом 189 видов млекопитающих фауны России и сопредельных стран, изучены тенденции эволюции кариотипа в основных отрядах млекопитающих, особенности организации и эволюции гетерохроматина у млекопитающих.

Им проведены первые отечественные работы по картированию геномов человека и животных с помощью метода гибридизации in situ, в том числе   FISH.   Изучаются синтенные группы генов и эволюционно-консервативные районы хромосом млекопитающих, в том числе при использовании хромосомного пейнтинга.

В лаборатории А.С. Графодатского проходили стажировку несколько десятков отечественных и зарубежных специалистов. На протяжении 6 лет (1995-2000 гг.) в Новосибирском государственном университете им читался спецкурс «цитогенетика». Он руководитель 9 успешно защищенных кандидатских диссертаций, руководитель ряда отечественных и зарубежных грантов (РФФИ, Геном человека, ИНТАС и др.)

Александр Сергеевич Графодатский родился 20.05.1951г. в   Новосибирске. После окончания в 1974 году Новосибирского государственного университета работал в Институте цитологии и генетики СО АН СССР старшим лаборантом, стажером-исследователем, младшим научным сотрудником, старшим научным сотрудником, с 1989 года– заведующий лабораторией цитогенетики животных ИЦиГ СО АН СССР.  С 2009 года – заведующий лабораторией цитогенетики животных Отдела молекулярной и клеточной биологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН. С 2012 года – заведующий лабораторией цитогенетики животных, заведующий Отделом разнообразия и эволюции геномов, заместитель директора по научной работе Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН.

В 1979 году защитил кандидатскую диссертацию по теме «Сравнительная цитогенетика куницеобразных (Carnivora, Mustelidae)» по специальности “генетика», в 1992году – защита докторской диссертации: «Цитогенетические аспекты филогении млекопитающих» по специальности «генетика». В 2003 году получил звание профессора по генетике.

Графодатский А.С. был членом Научного Совета Российской Государственной Научно-технической Программы «Геном человека», Объединенного Ученого совета СО РАН по биологическим наукам, Ученого совета ИЦиГ СО РАН, спецсоветам по защитам докторских диссертаций при Институте цитологии и генетики и Института систематики и экологии  животных СО РАН.  Он член Научного совета по генетике и селекции РАН (с 2012г.), член оргкомитета Project Genome 10K (c 2009г.), член Human Genome Organisation (HUGO) (c 1995г.), член Совета по защите докторских диссертаций при Институте молекулярной и клеточной биологии СО РАН.

Графодатский А.С. - член редакционных коллегий Chromosome Research (Germany), BMC Genetics (UK), Comparative Cytogenetics (Санкт-Петербург).

А.С. Графодатский в коллективе авторов является лауреатом премии СО АН СССР по фундаментальным наукам (1987г.), в 1995 году за фундаментальный вклад в изучение генома человека Графодатскому А.С. была присуждена премия Министерства науки и технической политики и ГПНТ «Геном человека» имени академика А.А. Баева.

Графодатский А.С.--автор более 160 научных публикаций, среди которых 4 монографии на русском языке и 4 на английском языке.

 

Избранные публикации

Графодатский А.С., Исаенко А.А., Терновский Д.В., Раджабли С.И. Конститутивный гетерохроматин и размеры геномов ряда видов куницеобразных (Carnivora, Mustelidae) // Генетика 13: 2123-2128, 1977.

Графодатский А.С., Раджабли С.И. Хромосомы сельскохозяйственных и лабораторных животных. Атлас. Новосибирск. Наука. 1988.

Graphodatsky AS. Conserved and variable elements of mammalian chromosomes in: //Halnan CRE, ed. Cytogenetics of animals, Oxon, UK: CAB International Press, 1989, pp 95-124.

Vorobieva N, Protopopov A, Protopopova M, Modi B, Alikmets R, Kashuba V, Zabarovsky E, Kisselev L, Klein G, Graphodatsky A. Localization of human arf2 and nck genes and 13 other Not1 linking clones to chromosome 3 by fluorescence in situ hybridization // Cytogenet Cell Genet 68: 91-94, 1995.

Yang F., O'Brien PCM, Milne BS, Graphodatsky AS, Solanky N, Trifonov V, Rens W, Sargan D, Ferguson-Smith MA. A complete comparative chromosome map for the dog, red fox and human and its integration with canine genetic maps // Genomics 62: 189-202, 1999.

Graphodatsky AS, Yang F, O’Brien PCM, Perelman P, Milne N, Serdukova N, Kawada S-I, Ferguson-Smith MA. Phylogenetic implications of the 38 putative ancestral chromosome segments for four canid species // Cytogenet Cell Genet 92: 243-247, 2001.

Graphodatsky AS, Yang F, Perelman PL, O'Brien PCM, Serdukova NA, Milne BS, Biltueva LS, Fu B, Vorobieva NV, Kawada S-I, Robinson TJ, Ferguson-Smith MA. Comparative molecular cytogenetic studies in the order Carnivora: mapping chromosomal rearrangements onto the phylogenetic tree  // Cytogenet Genome Res 96: 137-145, 2002.

Yang F, Alkalaeva EZ, Perelman PL, Pardini AT, Harrison WR, O’Brien PCM, Fu B, Graphodatsky AS, Ferguson-Smith MA. Reciprocal chromosome painting between human, aardvark and elephant (Superorder Afrotheria) reveals the likely eutherian ancestral karyotype //Proc Natl Acad Sci USA 100: 1062-1066, 2003.

Yang F. Graphodatsky A.S. Integrated comparative genome maps and their implications for karyotype evolution of carnivores. in: Chromosome today, Schmid M and Nanda I, eds. Kluwer Academic Publishers, The Netherlands 14: 215-224, 2004.

Graphodatsky AS, Kukekova AV, Yudkin DV, Trifonov VA, Vorobieva NV, Beklemisheva VR, Perelman PL, Graphodatskaya DA, Trut LN, Yang F., Ferguson-Smith MA, Acland GM, Aguirre GD. The proto-oncogene c-kit maps to canid B-chromosomes // Chromosome Res 13: 113-122, 2005.

Graphodatsky A. Contributed karyotypes. in: //Atlas of Mammalian Chromosomes, O’Brien SJ, Nash WG, Menninger JC, ed’s. John Wiley and Sons Publishers, 2006, 15, 44, 52, 177-180; 182-183; 187; 188; 200-216; 218; 220-221; 237-239; 241-252; 255-262; 264-268; 275; 277-278; 279; 281-283; 286-287; 310; 314-319; 322; 324, 341; 346; 360; 362-365; 366-369; 372-373; 374; 375-376; 377; 367-368; 462; 484-493; 494; 496; 497; 500; 509; 566; 574; 587; 591-592; 606; 610; 611; 649-650; 671; 652-653.

Yang F, Graphodatsky AS, Li T, Fu B, Dobigny G, Wang J, Perelman PL, Serdukova NA, Su W, O’Brien PCM, Wang Y, Ferguson-Smith MA, Volobouev V, Nie W. Comparative genome maps of the pangolin, hedgehog, sloth, anteater and human revealed by cross-species chromosome painting: further insight into the ancestral karyotype and genome evolution of eutherian mammals // Chromosome Res 14: 283-296, 2006.

Romanenko SA, Perelman PL, Serdukova NA, Trifonov VA, Biltueva LS, Wang J, Li T, Nie W, O’Brien PCM, Volobouev VT, Stanyon R, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Reciprocal chromosome painting between three laboratory rodent species // Mammalian Genome 17: 1183-1192, 2006.

Lutz F, Graphodatsky A, Muller S, Lyons LA, Robinson TJ, Volleth M, Yang F, Wienberg J. Are molecular cytogenetics and bioinformatics suggesting diverging models of ancestral mammalian genomes? // Genome Res 16: 306-310, 2006.

Графодатский АС. Сравнительная хромосомика // Мол Биол 41: 408-422, 2007.

Romanenko SA, Volobouev VT, Perelman PL, Lebedev VS, Serdukova NA, Trifonov VA, Biltueva LS, Nie W, O’Brien PCM, Bulatova NS, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Karyotype evolution and phylogenetic relationships of hamsters (Cricetidae, Muroidea, Rodentia) inferred from chromosomal painting and banding comparison // Chromosome Res 15: 283-297, 2007.

Graphodatsky AS, Perelman PL, Sokolovskaya NV, Beklemisheva VR, Serdukova NA, O’Brien SJ, Ferguson-Smith MA, Yang F. Phylogenomics of the dog and fox family (Canidae, Carnivora) revealed by chromosome painting // Chromosome Res 16: 129-143, 2008.

Graphodatsky AS, Yang F, Dobigny G, Romanenko SA, Biltueva LS, Perelman PL, Beklemisheva VR, Alkalaeva EZ, Serdukova NA, Ferguson-Smith MA, Murphy WJ, Robinson TJ. Tracking genome organization in rodents by ZOO-FISH //Chromosome Res 16: 261-274, 2008.

Yang F, Graphodatsky AS. Animal probes and ZOO-FISH fluorescence in situ hybridization (FISH) in: //Application guide, Liehr T, ed., Springer, 2009, 323-347.

Kulemzina AI, Trifonov VA, Perelman PL, Rubtsova NV, Volobuev V, Ferguson-SmithMA, Stanyon R, Yang F, Graphodatsky AS. Cross-species chromosome painting in Cetartiodactyla: reconstructing the karyotype evolution in key phylogenetic lineages // Chromosome Res 17: 419-436, 2009.

Genome 10K community of scientists. A proposal to obtain whole genome sequence for 10,000 vertebrate species // J Heredity 100: 659-674, 2009.

Beklemisheva VR, Romanenko SA, Biltueva LS, Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdukova NA, Rubtsova NV, Brandler OV, O'Brien PC, Yang F, Stanyon R, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Reconstruction of karyotype evolution in core Glires. I. The genome homology revealed by comparative chromosome painting // Chromosome Res 19: 549–565, 2011.

Vorobieva NV, Sherbakov DY, Druzhkova AS., Stanyon R, Tsybankov AA, Vasiljev SK, Shunkov MV, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Genotyping of Capreolus pygargus fossil DNA from Denisova Cave reveals phylogenetic relationships between ancient and modern populations // PLoS One 6(8): e24045, 2011.

Graphodatsky AS, Trifonov VA, Stanyon R. The genome diversity and karyotype evolution of mammals // Mol Cytogen 4: 22, 2011.

Romanenko SA, Perelman PL, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Rodentia // Heredity 108: 4-16, 2011

Stanyon R, Graphodatsky A. (Ed’s) Evolutionary dynamics of mammalian karyotypes. Karger, Basel, Switzerland, 2012, 208 pp.

Nie W, Wang J, Su W, Wang D, Tanomtong A, Perelman PL, Graphodatsky AS, Yang F. Chromosomal rearrangements and karyotype evolution in carnivores revealed by chromosome painting // Heredity 108: 17-27, 2012.

Romanenko SA, Perelman PL, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Rodentia // Heredity 108: 4-16, 2012.

Thalmann O,... , Druzhkova A, Graphodatsky A,... Wayne RK. Complete mitochondrial genomes of ancient canines suggest a European origin of domestic dogs // Science 342: 871-874, 2013.

Kulemzina AI, Perelman PL, Grafodatskaya DA, Nguyen TT, Thompson M, Roelke-Parker ME, Graphodatsky AS. Comparative chromosome painting of pronghorn (Antilocapra americana) and saola (Pseudoryx nghetinhensis) karyotypes with human and dromedary camel probes // BMC Genetics 15: 68, 2014.

 

 

 Использован материал из: http://www.mcb.nsc.ru/mcb/directorate/science_viceКонец формы