О программе
Уважаемые коллеги!
В последние 10 лет биология, медицина и биотехнология вышли на качественно новый уровень исследований, основанный на использовании высокопроизводительных экспериментальных технологий включая:
- массовое параллельное секвенирование геномной ДНК про- и эукариот; многопараметрическое профилирование экспрессии генов с использованием и биочипов, и полного секвенирования транскриптомов;
- многолокусное генотипирование, позволяющее выявлять тонкие особенности генетической изменчивости человека, животных, растений и микроорганизмов;
- протеомику и метаболомику, основанных на масс-спектрометрическом анализе протеомов клеток, органов и тканей, с расшифровкой аминокислотных последовательностей белков и точной идентификацией метаболитов;
- высокоразрешающую микроскопию, позволяющую исследовать биологические структуры на различных уровнях их организации, а также осуществлять сверхтонкие манипуляции с исследуемым биологическим материалом;
- методы направленного изменения информационного содержания геномов (нокауты и трансгенез), позволяющие создавать генетические модели патологий человека на основе лабораторных животных SPF-статуса;
- томографию и ЯМР-спектроскопию, позволяющих изучать прижизненные характеристики морфологии и функции лабораторных животных, а также тонкие особенности распределения метаболитов по их тканям и органам;
- биоинформатику, обеспечивающую компьютерный анализ огромных объемов получаемых экспериментальных данных, а также компьютерное моделирование биологических систем и процессов.
Для формирования в Сибирском отделении РАН центровкомпетенции - специализированных технологических кластеров, работающих с использованием высоких технологий современной биологии, была сформирована целевая программа <Геномика, протеомика, биоинформатика>, утвержденная постановлением Президиума СО РАН от 28.06.2007. В задачу центров компетенции входят:
- обеспечение инфраструктурной поддержки исследований, проводимых институтами СО РАН с использованием высоких технологий современной биологии;
- отслеживание передовых решений по приборно-методической базе этих технологий;
- распространение знаний о возможностях передовых технологий биологических исследований;
- образовательная деятельность - подготовка специалистов для работы на высокотехнологичном биологическом оборудовании.
В настоящее время в рамках Программы сформированы и работают центры компетенции по следующим направлениям:
- геномика;
- протеомика и метаболомика;
- биоинформатика;
- микроскопия биологических объектов;
- генетические модели патологий человека;
- постгеномная медицина.
В рамках Программы осуществляется взаимодействие с организациями, работающими по аналогичной тематике и оснащенными кластерами высокотехнологичного оборудования, в том числе с Центром Биоинженерия РАН, НИИ физико-химической медицины ФМБА России, Московским государственным университетом. Следует отметить, что программа Геномика, протеомика, биоинформатика позволила институтам СО РАН органично войти в крупные международные проекты, в частности в Международный консорциум по секвенированию генома пшеницы. Инфраструктура, созданная программой Геномика, протеомика, биоинформатика, предоставляет возможности как для сотрудничества с научными организациями СО РАН, СО РАМН, СО РАСХН и вузами Сибири, так и подготовки высококвалифицированных специалистов. В Новосибирском государственном университете такая подготовка осуществляется через кафедры информационной биологии, цитологии и генетики, физиологии и молекулярной биологии факультета естественных наук НГУ. Под эгидой компаний, поставляющих оборудование для высокотехнологичных исследований, проведено более 10 семинаров и рабочих совещаний, на которых были представлены новейшие достижения в области приборно-методической базы современной биологии. По тематике Программы за 2007-011 гг. проведено более 20 российских и международных конференций и школ молодых ученых включая такие крупные регулярно проходящие мероприятия, как международные конференции Биоинформатика регуляции и структуры геномов и Фундаментальные науки -медицине. Итоги работы за пять лет по перечисленным выше направлениям Программы нашли отражение в более чем 400 статей, опубликованных в рейтинговых научных журналах. Буклет, предлагаемый вашему вниманию, содержит информацию о состоянии приборнометодической базы центров компетенции Программы СО РАН Геномика, протеомика, биоинформатика и первых научных результатах, полученных на их основе.
Председатель Совета программы СО РАН <Геномика, протеомика, биоинформатика> академик Р.З. Сагдеев